Pengenalan Lingkungan Sekolah atau disebut PLS adalah sebuah kegiatan yang dilakukan pada hari pertama masuk sekolah dan wajib diikuti oleh semua siswa baru. Kegiatan tersebut berupa pengenalan lingkungan sekolah, program-program, metode belajar, sarana prasarana, konsep pengenalan diri serta pembinaan awal terhadap kultur sekolah. Kegiatan ini bertujuan untuk membangun kenyamanan dan rasa cinta almamater pada siswa. Hampir seluruh sekolah negeri maupun swasta menggunakan PLS untuk mengenalkan almamater pada peserta didik baru. Tahun 2022 kegiatan PLS dilakukan secara luring setelah dua tahun lamanya kegiatan sekolah dilakukan melalui daring karena pandemi virus covid 19. Kunjungan ke museum menjadi salah satu agenda kegiatan PLS sekolah-sekolah di Yogyakarta. Pada bulan Juli Museum Biologi menerima kunjungan rombongan sekolah dalam rangka kegiatan PLS, di antaranya kunjungan dari SLB N I Yogyakarta, SMP N 4 Sleman, dan SMP Muhammadiyah I Sleman. Para siswa baru melakukan tour keliling pameran sembari mencatat koleksi museum yang diamati dengan didampingi oleh staf museum. Kunjungan siswa baru ke museum tersebut diharapkan para siswa akan mendapatkan pengetahuan tentang hewan dan tumbuhan Indonesia koleksi Museum Biologi.
