Kepala Museum
| Tahun | Nama | Asal |
| 1969 – 2001 | Drs. Anthon Sukahar | Lab. Taksonomi Hewan |
| 2001 – 2002 | Dr. Mammed Sagi | Lab. Embriologi dan Histologi Hewan |
| 2003 – 2004 | Dr. RC. Hidayat Soesilohadi, MS. | Lab. Entomologi |
| 2005 – 2007 | Dr. L. Hartanto Nugroho, M.Agr. | Lab. Anatomi Tumbuhanumbuhan |
| 2008 – 2009 | Drs. Trijoko, M.Si. | Lab. Taksonomi Hewan |
| 2010 – 2011 | Ludmila Fitri Untari, S.Si., M.Si., | Lab. Taksonomi Tumbuhan |
| 2012 – 2013 | Donan Satria Yudha, S.Si., M.Sc. | Lab. Sistematika Tumbuhan |
| 2014 – 2015 | Drs. Trijoko, M.Si. | Lab. Taksonomi Hewan |
| 2016 – September 2021 | Donan Satria Yudha, S.Si., M.Sc. | Lab. Taksonomi Hewan |
| Oktober 2021 – April 2022 | Drs. Trijoko, M.Si. | Lab. Taksonomi Hewan |
| Mei 2022 – sekarang | Mulyanto, S.T.,M.M |
Staf Museum
| Nama | Jabatan |
| Murdiyanto | Administrasi Museum |
| Ida Suryani, S.S. | Petugas Pemelihara Koleksi Museum |
| FX. Sugiyo Pranoto, S.Si. | Petugas Pemelihara Koleksi Museum |